在《辐射4》中，玩家可以在游戏的主要剧情发展过程中做出选择加入不同的阵营。而关于最后的选择，玩家需要在游戏的最后任务中做出决定，加入或者背叛“铁路”、“博士组织”或“钢铁兄弟会”。这个选择将会对游戏的结局及玩家在游戏世界中的影响产生较为重要的影响。
在《辐射4》中，玩家可以在游戏的主要剧情发展过程中做出选择加入不同的阵营。
玩家首次需要在游戏的起始任务中选择加入的阵营，可以选择美国的前军人组织“美国卫队”（Minutemen）或者是秘密组织“铁路”（Railroad），或者是游荡在废土上的猎人组织“钢铁兄弟会”（Brotherhood of Steel），或者是殖民地居民组成的组织“废土生活”（The Commonwealth Wastelanders）。这个选择不会对后续的剧情影响太大。
而关于最后的选择，玩家需要在游戏的最后任务中做出决定，加入或者背叛“铁路”、“博士组织”（Institute）或“钢铁兄弟会”。这个选择将会对游戏的结局及玩家在游戏世界中的影响产生较为重要的影响。